Анализ популяционной генетики онлайн

Закон Харди-Вайнберга — это фундамент популяционной генетики. Он утверждает, что при отсутствии возмущающих факторов частоты аллелей и генотипов в популяции остаются постоянными из поколения в поколение.

Наш калькулятор — это профессиональный инструмент, который позволяет не только найти частоты аллелей, но и статистически проверить, находится ли исследуемая популяция в состоянии генетического равновесия.

Основные формулы (The Equations)

Для локуса с двумя аллелями (обычно обозначаемыми как $A$ и $a$) используются два базовых уравнения.

  1. Частота аллелей:$$p + q = 1$$
    • $p$ — частота доминантного аллеля ($A$).
    • $q$ — частота рецессивного аллеля ($a$).
  2. Частота генотипов:$$p^2 + 2pq + q^2 = 1$$
    • $p^2$ — частота гомозиготных доминантных особей ($AA$).
    • $2pq$ — частота гетерозигот ($Aa$).
    • $q^2$ — частота гомозиготных рецессивных особей ($aa$).

Возможности калькулятора

В отличие от простых школьных калькуляторов, наш инструмент работает в двух режимах и проводит статистический анализ:

1. Режим «Количество особей»

Идеально подходит для обработки экспериментальных данных. Вы вводите наблюдаемое число особей каждого генотипа ($AA, Aa, aa$), а программа:

  • Рассчитывает частоты $p$ и $q$.
  • Вычисляет ожидаемое количество особей (если бы популяция была в идеальном равновесии).
  • Проводит тест Хи-квадрат Пирсона ($\chi^2$) для проверки статистической значимости отклонений.

2. Режим «Частота аллелей»

Полезен для теоретического моделирования. Вы задаете известную частоту (например, $p = 0.6$), а калькулятор мгновенно строит распределение генотипов в популяции.

Интерпретация теста Хи-квадрат ($\chi^2$)

Это самая важная часть анализа реальных популяций. Калькулятор сравнивает «Наблюдаемое» (Observed) с «Ожидаемым» (Expected).

Значение χ2Заключение (при p=0.05, df=1)Что это значит?
< 3.841В равновесииРазличия между наблюдаемыми и ожидаемыми данными незначительны и случайны. Закон Харди-Вайнберга соблюдается.
> 3.841НЕ в равновесииРазличия статистически значимы. На популяцию действуют факторы эволюции или выборка неслучайна.

Условия соблюдения равновесия

Если калькулятор показывает, что популяция не находится в равновесии (высокий Хи-квадрат), это означает, что нарушено одно из 5 ключевых условий закона Харди-Вайнберга:

  1. Нет мутаций: Новые аллели не возникают.
  2. Нет миграции (потока генов): Особи не покидают популяцию и не входят в нее извне.
  3. Случайное скрещивание (панмиксия): Особи выбирают партнеров без предпочтений по генотипу.
  4. Нет естественного отбора: Все генотипы имеют равные шансы на выживание и размножение.
  5. Бесконечно большая популяция: Чтобы исключить влияние дрейфа генов.